食水和海水，分別由兩組完全獨立的抽水站、配水庫及水管供應。水在離開濾水廠或由海中抽取後，便利用抽水機或水向低流原理輸送到位於不同地點、不同高度的配水庫，再供應給各地區。位於交通方便地點的配水庫上蓋，通常由康樂及文化事務署發展作休憩用途。

運用水向低流的原理，配水庫的水可通過廣泛的水管網絡供應給客戶。系統內的水壓一般可將水供應到離地面六、七層樓的高度。多層大廈的高層便由自設的抽水系統將水抽至本身的天台水箱再供應。港島半山等較高地區，則須分階段將水抽至位於不同高度的配水庫。至於偏遠村落，分配系統內的水壓通常足以將水直接供應至離地面三層樓的高度。

輸水網絡亦是以機械抽水或水向低流的原理，將水由一個地點轉運到另一地點。大部分的抽水設備均使用電力。而水務署是香港最大的電力用戶之一。

水務署採用監控及資料收集系統，以改善對輸水程序的中央監察和操控。這個系統可把各水務設施的即時資料訊息連接起來，並可提供有效地進行即時監察及控制的資料。