截至2012年4月1日止本署的總員工編制為4,404人,其中349名為專業及助理專業人員。

專業人員
土木工程師 231
電機工程師 38
機械工程師 41
水務化驗師 26
會計師 6
土地測量師 1
工料測量師 2
土力工程師 2
園境師 1
統計師 1
小計: 349
技術人員 1,957
一般職系及初級人員 2,098
合計: 4,404